RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 PHF21AQ96BD5 680 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 MMP27Q9H306 513 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 ZNF221Q9UK13 617 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 H0YJW9 148 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 XRCC3O43542 346 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 TSPAN15O95858 294 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 CSF1P09603 554 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 CTXN2P0C2S0 81 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 OR8U9P0C7N5 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 LINC00205P59089 165 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 GNG2P59768 71 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 ACTBP60709 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 NCS1P62166 190 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 OR8U1Q8NH10 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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PPARG-201ENST00000287820 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-201ENST00000287820 OR5H14A6NHG9 310 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 SCGB1D2O95969 90 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 CNTFRP26992 372 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 GPR12P47775 334 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 CNIH2Q6PI25 160 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ZNF329Q86UD4 541 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 AP4M1O00189 453 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 GABARAPO95166 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 NDUFA3O95167 84 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 SOX6P35712 828 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 MMDQ15546 238 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 GPR107Q5VW38 600 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 STPG2Q8N412 459 aa6.64□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ZNF383Q8NA42 475 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 GINS4Q9BRT9 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 PSMB11A5LHX3 300 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 NBR2O15453 112 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 KCNAB3O43448 404 aa6.63□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 OPN1MWP04001 364 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 IGF1P05019 195 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 PTHLHP12272 177 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 RORCP51449 518 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 LIN54Q6MZP7 749 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 HOGA1Q86XE5 327 aa6.63□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ZNF580Q9UK33 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.63□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 M0R1X1 148 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 FCN1O00602 326 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 TUSC2O75896 110 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 HLA-DRB1P01911 266 aa6.62□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 IGKV1-16P04430 117 aa6.62□□□□□ -1.35
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PPARG-201ENST00000287820 GPR141Q7Z602 305 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 COMMD1Q8N668 190 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 BEST4Q8NFU0 473 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 C5orf30Q96GV9 206 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 GON7Q9BXV9 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 OR2D2Q9H210 308 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.62□□□□□ -1.35
PPARG-201ENST00000287820 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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