RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB121Q5J5C9 76 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM3DQ96BQ1 224 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1456Q9P272 454 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLOC1S6Q9UL45 172 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSF4Q9ULV5 492 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MGAT4AQ9UM21 535 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 V9GY05 133 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERICH4A6NGS2 130 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA12AO43301 675 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEACAM6P40199 344 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMD7P51665 324 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM50BP56557 158 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFHR3Q02985 330 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL39P5Q59GN2 51 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM71F2Q6NXP2 309 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF152Q8N8N0 203 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB25P24278 435 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DRB3P79483 266 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIR2DS1Q14954 304 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB136Q30KP8 78 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HES5Q5TA89 166 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIN54Q6MZP7 749 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM131AQ6UXB0 335 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF367Q7RTV3 350 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR56B1Q8NGI3 324 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR8U1Q8NH10 309 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABHD14BQ96IU4 210 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PECRQ9BY49 303 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51J1Q9H342 316 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C12orf4Q9NQ89 552 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP11Q9NR21 331 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR1A1Q9P1Q5 309 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF580Q9UK33 172 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DRB1P01911 266 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM65Q6PI78 240 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q9N2K0 584 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H7C2Y5 167 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6V0E1O15342 81 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCTP09683 121 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A6P0DMU7 189 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A5P0DMU8 189 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A7P0DMV0 189 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMB8P28062 276 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPBQ8NG41 125 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GHITMQ9H3K2 345 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB22AQ9UL26 194 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAH3Q8TD57 4116 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3V318 75 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGB1BP1O14713 200 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDCD5O14737 125 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MC5RP33032 325 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSX1Q16384 188 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF150Q9ULK6 438 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV41A0A0B4J266 112 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5H14A6NHG9 310 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFA3O95167 84 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLGLAQ15195 96 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLAC9Q5JTB6 97 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5M8Q8NGP6 311 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C4orf3Q8WVX3 66 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGMATQ9BSE5 352 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXL15Q9H469 300 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB26Q9ULW5 256 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRDCB7Z8K6 153 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H0YJW9 148 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LDLRAD4O15165 306 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD3GP09693 182 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL9P24844 172 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIFP30405 207 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLA2G7Q13093 441 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB3CQ96E17 227 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLK15Q9H2R5 256 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF221Q9UK13 617 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRHO14718 337 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10A3P58181 314 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms