RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 DSCR9P59020 149 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TAS2R60P59551 318 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCL7P80098 99 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LCN2P80188 198 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAB30Q15771 203 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF542PQ5EBM4 170 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q5PR19 223 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 NCMAPQ5T1S8 102 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR2T2Q6IF00 324 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC25A26Q70HW3 274 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 MOB1BQ7L9L4 216 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 RTN4RL2Q86UN3 420 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF383Q8NA42 475 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR10A7Q8NGE5 316 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR5D18Q8NGL1 313 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR5L1Q8NGL2 311 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCGB1C1Q8TD33 95 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TOMM40LQ969M1 308 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 FBXO17Q96EF6 278 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 REEP6Q96HR9 211 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ULBP2Q9BZM5 246 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 WDR54Q9H977 334 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDH20Q9HBT6 801 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 MANBALQ9NQG1 85 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 FGF21Q9NSA1 209 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAT8Q9UHE5 227 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 VAX2Q9UIW0 290 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 CD207Q9UJ71 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 HTTP42858 3142 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A087X0M5 115 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1B0GX30 115 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 C17orf51A8MQB3 221 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF212BA8MTL3 300 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 C9J4A7 227 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 H0YL77 283 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNFSF11O14788 317 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 PHOX2AO14813 284 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 NKX2-8O15522 239 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADAM20O43506 726 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAMP1O60894 148 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR2J2O76002 312 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 YIF1AO95070 293 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 HLA-HP01893 362 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRGC2P03986 189 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LCATP04180 440 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TYMSP04818 313 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SERPINA7P05543 415 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SOD3P08294 240 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 COX5BP10606 129 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 DAOP14920 347 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 LIFP15018 202 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 MYOGP15173 224 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 GNRHRP30968 328 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 HOXA6P31267 233 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 OPRM1P35372 400 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMPRSS3P57727 454 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 FXYD4P59646 89 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPCS3P61009 180 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms