RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631		Q3ZCU0	254 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631		Q5PR19	223 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631		M0R1W7	72 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	HSD17B6	O14756	317 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC22A5	O76082	557 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	S100G	P29377	79 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB7A	P51149	207 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	PIGP	P57054	158 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	LCN2	P80188	198 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
RNPS1-223	ENST00000568631	FBN2	P35556	2912 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A087X0M5	115 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1B0GX30	115 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	DHODH	Q02127	395 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	MSMO1	Q15800	293 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	BVES	Q8NE79	360 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	RND3	P61587	244 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CBX3	Q13185	183 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM157A	C9JC47	383 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	VAMP1	P23763	118 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF134	P52741	427 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	PAX2	Q02962	417 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	DHRS2	Q13268	280 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	GPR12	P47775	334 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	GNG10	P50151	68 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	ARF6	P62330	175 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	UTF1	Q5T230	341 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CADM3	Q8N126	398 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC31A2	O15432	143 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	MPPED1	O15442	326 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNPS1-223	ENST00000568631	SFT2D2	O95562	160 aa		13.24	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms