RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397787.5

COL18A1-AS1-201, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COL18A1-AS1, Length 3,425 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LIFP15018 202 aa11.71□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TAS2R30P59541 319 aa11.71□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TCF23Q7RTU1 214 aa11.71□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PSENENQ9NZ42 101 aa11.71□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SIAH2O43255 324 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NRASP01111 189 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 S100A7P31151 101 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PSMB3P49720 205 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 Q0VFX4 171 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 V9GYS6 101 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IRF2P14316 349 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NPBWR2P48146 333 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NUBP1P53384 320 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PLGLB1Q02325 96 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BAXQ07812 192 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR5R1Q8NH85 324 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EXTL1Q92935 676 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LOXL4Q96JB6 756 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 Q96M66 194 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TXN2Q99757 166 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZPBPQ9BS86 351 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CBR3O75828 277 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCL2P13500 99 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H3AP68431 136 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NAGKQ9UJ70 344 aa11.7□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GZMHP20718 246 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PP6455Q8WZ26 134 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IMMP2LQ96T52 175 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CXCL13O43927 109 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PAGE4O60829 102 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TUSC2O75896 110 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TNFSF10P50591 281 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OXGR1Q96P68 337 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HES7Q9BYE0 225 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ARV1Q9H2C2 271 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ABI3Q9P2A4 366 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RNF24Q9Y225 148 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HPRT1P00492 218 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SFTPCP11686 197 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SELEP16581 610 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 THBS3P49746 956 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C18orf12Q96KH6 178 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DIRC2Q96SL1 478 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NAT8Q9UHE5 227 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 VAX2Q9UIW0 290 aa11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MED13Q9UHV7 2174 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 B4DEV8 164 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RNF150Q9ULK6 438 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PSG2P11465 335 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ERVFC1-1P60608 527 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ADGRG7Q96K78 797 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 YPEL4Q96NS1 127 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.68□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 A0A0J9YW62 118 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CDS2O95674 445 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GCGP01275 180 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TDRG1Q3Y452 100 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SSX7Q7RTT5 188 aa11.67□□□□□ -0.54
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 VASH2Q86V25 355 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms