RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 A0A1W2PPI3 338 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 PSMB11A5LHX3 300 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 C15orf65H3BRN8 121 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SLC22A1O15245 554 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 HSPA12AO43301 675 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 ATP6V1G2O95670 118 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 VSIG8P0DPA2 414 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 MAP2K4P45985 399 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 IRF3Q14653 427 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 STEAP3Q658P3 488 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 LINC00311Q8N616 119 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CFHR4Q92496 578 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 JPT1Q9UK76 154 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 NUDT19A8MXV4 375 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SLC17A2O00624 439 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 FGF16O43320 207 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SC5DO75845 299 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 MOSP00540 346 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CD33P20138 364 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 GADD45AP24522 165 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 PSMB9P28065 219 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CHATP28329 748 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CD1BP29016 333 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 GABARAPL2P60520 117 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 UTF1Q5T230 341 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 S1PR3Q99500 378 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 GON7Q9BXV9 100 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 V9GY05 133 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 TGP01266 2768 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC6-232ENST00000489053 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 KCNAB3O43448 404 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 CD3GP09693 182 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 VEGFCP49767 419 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 LOXL3P58215 753 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 HTD2P86397 168 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 FABP5Q01469 135 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 Q6ZS46 218 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 C1QL4Q86Z23 238 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 FCGR1BQ92637 280 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 NICN1Q9BSH3 213 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 TM2D1Q9BX74 207 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 KCNK15Q9H427 330 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 KIAA1456Q9P272 454 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 A0A075B6Q4 140 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 AP4M1O00189 453 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 SLC31A2O15432 143 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 LANCL1O43813 399 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 VDAC1P21796 283 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 ZBTB25P24278 435 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 SOX6P35712 828 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 TALDO1P37837 337 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 CLDN12P56749 244 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 UNC119Q13432 240 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 PLGLAQ15195 96 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 MMDQ15546 238 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 MORN2Q502X0 79 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC6-232ENST00000489053 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.3 ms