RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SULT1A1P50225 295 aa14.37□□□□□ -0.11
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.37□□□□□ -0.11
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC11BP0C7V7 166 aa14.34□□□□□ -0.11
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.33□□□□□ -0.11
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.33□□□□□ -0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.33□□□□□ -0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX6A1P12074 109 aa14.33□□□□□ -0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.33□□□□□ -0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
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