RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 RFESDQ8TAC1 157 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 RPEQ96AT9 228 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OPALINQ96PE5 141 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MGLLQ99685 303 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CALYQ9NYX4 217 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 GLS2Q9UI32 602 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 KIF25Q9UIL4 384 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PSG11Q9UQ72 335 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.11□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CCRL2O00421 344 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 DEGS1O15121 323 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 FGF16O43320 207 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 RAMP3O60896 148 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 GABARAPO95166 117 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CYB5AP00167 134 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PRKACBP22694 351 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A1P30531 599 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 GLP1RP43220 463 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CFHR3Q02985 330 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 EBI3Q14213 229 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 HES1Q14469 280 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 IRF3Q14653 427 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DS1Q14954 304 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SPHARQ15513 63 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CASC10Q5T4H9 136 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.11□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N6K4 173 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N9W7 124 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SPSB1Q96BD6 273 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS12Q96DT0 336 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.11□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 J3QRE1 110 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ZFPL1O95159 310 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 IL1AP01583 271 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ISG15P05161 165 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SSTR5P35346 364 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SOX6P35712 828 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 GPR12P47775 334 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 REG1BP48304 166 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 WNT4P56705 351 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.1□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR8H3Q8N146 312 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N1Y9 231 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD1Q8N668 190 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 RNF152Q8N8N0 203 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CHST4Q8NCG5 386 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ABCG5Q9H222 651 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PALMDQ9NP74 551 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa5.1□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 SSR3Q9UNL2 185 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B6O14756 317 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CHATP28329 748 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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