RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 CD24P25063 80 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SDC2P34741 201 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 RORCP51449 518 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 EBI3Q14213 229 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 INSL4Q14641 139 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 UTF1Q5T230 341 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 C6orf183Q5T699 404 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CST11Q9H112 138 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.2■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PPI3 338 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SPINT2O43291 252 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CD37P11049 281 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 MGMTP16455 207 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LOXL3P58215 753 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 RAB12Q6IQ22 244 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 Q96M66 194 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 GFOD1Q9NXC2 390 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ETAA1Q9NY74 926 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 NOTCH1P46531 2555 aa16.19■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 IL3RAP26951 378 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 MXD1Q05195 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.18■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 PDCD5O14737 125 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TXNL1O43396 289 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LPLP06858 475 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 RANBP1P43487 201 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LINC00299Q6ZSB3 139 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 DRAM1Q8N682 238 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TMEM104Q8NE00 496 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 OR56B4Q8NH76 319 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 MCFD2Q8NI22 146 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 AP3S1Q92572 193 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LEAP2Q969E1 77 aa16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 HSD17B6O14756 317 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SRMP19623 302 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 GNG10P50151 68 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ZNF137PP52743 207 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LSAMPQ13449 338 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 LTC4SQ16873 150 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 R3HDM4Q96D70 268 aa16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 C12orf77C9JDV5 145 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 PDCD6O75340 191 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-7P01780 117 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 TMEM11P17152 192 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 RAB3BP20337 219 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 CCDC107Q8WV48 283 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 BANF2Q9H503 90 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX3-201ENST00000370002 BPNT1O95861 308 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 CD1BP29016 333 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 PSMD7P51665 324 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 HES1Q14469 280 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 A0A075B6Q4 140 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 TMEM127O75204 238 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 HTD2P86397 168 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX3-201ENST00000370002 FBLN7Q53RD9 439 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms