RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF616Q08AN1 781 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q8WTZ3 238 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RAXQ9Y2V3 346 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CYB5BO43169 146 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 XRCC2O43543 280 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 AQP10Q96PS8 301 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DVL1O14640 695 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TFF1P04155 84 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TRGC1P0CF51 173 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CHATP28329 748 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MALLQ13021 153 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZSR3 168 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 COMMD1Q8N668 190 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SPSB4Q96A44 273 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 H0YL77 283 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 METTL15P1P0C7V9 234 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZT83 130 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q96M66 194 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 WDR1O75083 606 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MPV17P39210 176 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ELOBQ15370 118 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PRRT1Q99946 306 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 AK3Q9UIJ7 227 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 GLI4P10075 376 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 BMP5P22003 454 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 GUSBP1Q15486 140 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 NRN1LQ496H8 165 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC22A25Q6T423 547 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZPA2 131 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SPSB1Q96BD6 273 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 A6NNC1 897 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 AMY2BP19961 511 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FABP6P51161 128 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 WDR31Q8NA23 367 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TAAR5O14804 337 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CHRM2P08172 466 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FUT6P51993 359 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 C4orf17Q53FE4 359 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q8NA96 180 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ACACBO00763 2458 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 IFNA6P05013 189 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FRZBQ92765 325 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LIME1Q9H400 295 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0A6YYH2 397 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 A6NJ64 397 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CST4P01036 141 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TGFBR3Q03167 851 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TBR1Q16650 682 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SMPD2O60906 423 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OSR2Q8N2R0 312 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 UBALD1Q8TB05 177 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MSL2Q9HCI7 577 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 AKAP6Q13023 2319 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA12AO43301 675 aa15.21■□□□□ 0.02
PDE4D-204ENST00000358923 FAM27E3Q08E93 113 aa15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms