RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821		V9GY05	133 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	CCRL2	O00421	344 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	ARSB	P15848	533 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-215	ENST00000582821	VWF	P04275	2813 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	PDCD5	O14737	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SPINT2	O43291	252 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MNDA	P41218	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RAB11B	Q15907	218 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LTC4S	Q16873	150 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF773	Q6PK81	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RPE	Q96AT9	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		A0A0A6YYD4	124 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RAB7A	P51149	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	P2RY14	Q15391	338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TIMM23	O14925	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	NAPSA	O96009	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HBZ	P02008	142 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	GNG10	P50151	68 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CFHR4	Q92496	578 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PPE3	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PPI3	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	OR2F2	O95006	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	MYL9	P24844	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CD24	P25063	80 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	PSMB9	P28065	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF134	P52741	427 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF137P	P52743	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM50B	P56557	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	CLDN12	P56749	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-215	ENST00000582821	BLCAP	P62952	87 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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