RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 LINC00052Q96N35 136 aa6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 WASF3Q9UPY6 502 aa6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.29□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ESPL1Q14674 2120 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 A0A1B0GWJ7 208 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OOEPA6NGQ2 149 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 LCE2BO14633 110 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MED6O75586 246 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ATG12O94817 140 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 AVPP01185 164 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 SLC25A6P12236 298 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 TNFSF4P23510 183 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 LMO1P25800 156 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 GLRXP35754 106 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 SULT1A2P50226 295 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM33P57088 247 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 BAXQ07812 192 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 CATR1Q13166 79 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF266Q14584 549 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MSMO1Q15800 293 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 IGFBP7Q16270 282 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 WDR82Q6UXN9 313 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 FAM219AQ8IW50 185 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 PRR18Q8N4B5 295 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OR51H1Q8NH63 302 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 LRRC29Q8WV35 223 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MSL2Q9HCI7 577 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 RAB9BQ9NP90 201 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 MMP26Q9NRE1 261 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 FZR1Q9UM11 496 aa6.28□□□□□ -1.4
UBXN8-204ENST00000518059 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 A0A1B0GU03 582 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 B8ZZF3 427 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 WNT9BO14905 357 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 SPINT2O43291 252 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 TNFSF12O43508 249 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 SSSCA1O60232 199 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 PITX3O75364 302 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 IGHV3-13P01766 116 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 SEC11BP0C7V7 166 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 CEACAM6P40199 344 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 GABRA2P47869 451 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 OR3A1P47881 315 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 RAB5CP51148 216 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 CAV2P51636 162 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 AKR1C2P52895 323 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 RBPJQ06330 500 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 TESK1Q15569 626 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 NMSQ5H8A3 153 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 Q6ZR03 302 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 OR2C3Q8N628 320 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 GALMQ96C23 342 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 PARP11Q9NR21 331 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 LUZP4Q9P127 313 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 DUSP13Q9UII6 198 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 CFAP54Q96N23 3096 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.26□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.26□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 SRRM5B3KS81 715 aa6.26□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 C12orf77C9JDV5 145 aa6.26□□□□□ -1.41
UBXN8-204ENST00000518059 J3QL48 77 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms