RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB1	P62873	340 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CFHR3	Q02985	330 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6P435	159 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX6	Q7RTT6	188 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RDH10	Q8IZV5	341 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC1A	Q92747	370 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK15	Q9H2R5	256 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51J1	Q9H342	316 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOF	Q9HBH0	211 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01619	G3V211	115 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		I3L521	148 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R129	80 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF1	P05019	195 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8U9	P0C7N5	309 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SSTR5	P35346	364 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PITPNA	Q00169	270 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	UTS2B	Q765I0	119 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	GID4	Q8IVV7	300 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N6K4	173 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17D	Q8TAD2	202 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF503	Q96F45	646 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP11	Q9NR21	331 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG8	Q9UK08	70 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A17	O43808	307 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1C4	O75897	302 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T7	P0C7T2	308 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CGB3	P0DN86	165 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CGB7	P0DN87	165 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSB	P15848	533 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CD1B	P29016	333 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RUNX1	Q01196	453 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MMD	Q15546	238 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD6	Q86Y78	171 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		8.36	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V318	75 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNL1	O43396	289 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MTNR1B	P49286	362 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB9A	P51151	201 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	F2RL1	P55085	397 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A2	Q01362	244 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5R1	Q15078	307 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53I3	Q53FA7	332 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSM6	Q6P461	480 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	UBALD1	Q8TB05	177 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM163	Q8TC26	289 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA4B	Q9H853	241 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0E1	O15342	81 aa		8.34	□□□□□ -1.07

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