RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LANCL1O43813 399 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORC5O43913 435 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPPPO94811 219 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAP2AP10114 183 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR13C9Q8NGT0 318 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBX5Q99593 518 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB9BQ9NP90 201 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM53CQ9NYF3 392 aa12.58□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKYO43930 277 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISG15P05161 165 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2T7P0C7T2 308 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPPP2P59282 170 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMS2P11Q13670 270 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STEAP3Q658P3 488 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHFR2Q86XF0 187 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB107AQ8IZN7 70 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ETAA1Q9NY74 926 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHDHQ9UQ10 334 aa12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC31A2O15432 143 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEB3O15480 346 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRISP1P54107 249 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD81P60033 236 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KISS1Q15726 138 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOGAT2Q3SYC2 334 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACTBL2Q562R1 376 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AADACL4Q5VUY2 407 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GID4Q8IVV7 300 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PXT1Q8NFP0 134 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPBQ8NG41 125 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO7Q9Y3I1 522 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.56□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA3O95167 84 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDPQ00604 133 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TATDN3Q17R31 274 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKIRIN2Q53H80 203 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAX1Q8IWV1 398 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC9Q8WXX5 260 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MS4A10Q96PG2 267 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG12Q9UBI6 72 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.55□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEDDO75618 318 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF134P52741 427 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CX3CL1P78423 397 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF691Q5VV52 312 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBALD1Q8TB05 177 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM163Q8TC26 289 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RITA1Q96K30 269 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEURL2Q9BR09 285 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT22Q9H7X7 185 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG8Q9UK08 70 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KMT2AQ03164 3969 aa12.54□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINT2O43291 252 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRGV3P03979 118 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFAP2AP05549 437 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKACGP22612 351 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIGYQ3MUY2 71 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCEANCQ8N8B7 351 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10H4Q8NGA5 316 aa12.53□□□□□ -0.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0G2JLM5 398 aa12.52□□□□□ -0.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms