RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 CDK5R1Q15078 307 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CST11Q9H112 138 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 TVP23BQ9NYZ1 205 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.49□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V0E1O15342 81 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZP3P21754 424 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CD40LGP29965 261 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF137PP52743 207 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 MMDQ15546 238 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 PARP11Q9NR21 331 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 NDE1Q9NXR1 346 aa11.48□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 SHISA3A0PJX4 238 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 METTL15A6NJ78 407 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RGS11O94810 467 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF20P17024 532 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 SSTR5P35346 364 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 STEAP3Q658P3 488 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ELP2Q6IA86 826 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 LCN12Q6JVE5 192 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 LIN54Q6MZP7 749 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 TMEM106AQ96A25 262 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RAB9BQ9NP90 201 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RNF150Q9ULK6 438 aa11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 NUPR2A6NF83 97 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 HSPB6O14558 160 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CNIH1O95406 144 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ANXA8P13928 327 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 FGGYQ96C11 551 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.46□□□□□ -0.57
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PN81 502 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ORC5O43913 435 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CST1P01037 141 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ISG15P05161 165 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR2T7P0C7T2 308 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TMEM225BP0DP42 221 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CHRNA7P36544 502 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 VHLP40337 213 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 IL13RA2Q14627 380 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 Q8N402 240 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ARL11Q969Q4 196 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RFT1Q96AA3 541 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RHOVQ96L33 236 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SPACA5Q96QH8 159 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 KIAA1456Q9P272 454 aa11.45□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 GNGT2O14610 69 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 MAGEB3O15480 346 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RAP2AP10114 183 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ACTBP60709 375 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 RETNQ9HD89 108 aa11.44□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 NBR2O15453 112 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 LANCL1O43813 399 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1B2P21281 511 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 LSAMPQ13449 338 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 TATDN3Q17R31 274 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.43□□□□□ -0.58
NELFE-204ENST00000436289 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114 ms