RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 KIRREL1Q96J84 757 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 DUX5Q96PT3 197 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 CENPOQ9BU64 300 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.57■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 PAHP00439 452 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SDC2P34741 201 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IER3P46695 156 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 DYRK2Q92630 601 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 RAB22AQ9UL26 194 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 UBE2QL1A1L167 161 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C15orf65H3BRN8 121 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ORC5O43913 435 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SSTR5P35346 364 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ABHD12Q8N2K0 398 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 CYYR1Q96J86 154 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SMIM30A4D0T7 59 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SOCS1O15524 211 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 RAB6AP20340 208 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 PLA2G7Q13093 441 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 AANATQ16613 207 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 TRAT1Q6PIZ9 186 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC107Q8WV48 283 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 PTX4Q96A99 478 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MALSU1Q96EH3 234 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 HSF4Q9ULV5 492 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 AIREO43918 545 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IGLV1-47P01700 117 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV4-59P01825 116 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 FAM189A2Q15884 450 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C6orf183Q5T699 404 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C16orf87Q6PH81 154 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 OR4K15Q8NH41 348 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 RFESDQ8TAC1 157 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF596Q8TC21 504 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 ARL11Q969Q4 196 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.53■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 A0A0B4J203 849 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 NFYBP25208 207 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 VEGFCP49767 419 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM50BP56557 158 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 CHIAQ9BZP6 476 aa16.52■□□□□ 0.24
CLDN3-201ENST00000395145 FAM172BPA6NC97 362 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 VGLL3A8MV65 326 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 C12orf77C9JDV5 145 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 F2RL2O00254 374 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 NAPSAO96009 420 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 HTR1DP28221 377 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 EFNB2P52799 333 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 MXD1Q05195 221 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 UTF1Q5T230 341 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 OR5R1Q8NH85 324 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 OR9G1Q8NH87 305 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 RAB9BQ9NP90 201 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 STAB1Q9NY15 2570 aa16.51■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 BTBD17A6NE02 478 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM127O75204 238 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 PRRX1P54821 245 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 SCAND1P57086 179 aa16.5■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 RPL15P61313 204 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CLDN3-201ENST00000395145 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms