RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567060.5

CLN6-208, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 2

Gene CLN6, Length 945 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TGFBR1	P36897	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PDCD1	Q15116	288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	COQ2	Q96H96	371 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RAB27B	O00194	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	GZMH	P20718	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	VEGFC	P49767	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	AES	Q08117	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060		Q6ZTK2	550 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060		A0A0A6YYD4	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060		H3BMQ9	156 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	HSPB6	O14558	160 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TOX4	O94842	621 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MMP9	P14780	707 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PRTN3	P24158	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060		A0A0B4J203	849 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SOCS1	O15524	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ORC5	O43913	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PAH	P00439	452 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MT-ND4	P03905	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	GLIPR1	P48060	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM50B	P56557	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ARF6	P62330	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF273	Q14593	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	SPCS2	Q15005	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	APOA1	P02647	267 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	EFNB2	P52799	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	DLX6	P56179	175 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	PITPNA	Q00169	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLN6-208	ENST00000567060	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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