RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	XAF1	Q6GPH4	301 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF529	Q6P280	563 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914		Q6ZS46	218 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00596	Q86U02	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OSR2	Q8N2R0	312 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	STX19	Q8N4C7	294 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	NEK7	Q8TDX7	302 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	IL36G	Q9NZH8	169 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	LY6L	H3BQJ8	138 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OGG1	O15527	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CLIC3	O95833	236 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	IGHV3-7	P01780	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	PF4	P02776	101 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CD33	P20138	364 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	GZMH	P20718	246 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	RAB7A	P51149	207 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TAS2R43	P59537	309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	PAX5	Q02548	391 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	MPV17L	Q2QL34	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914		Q499Y3	187 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ASCL4	Q6XD76	172 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR8H3	Q8N146	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914		Q8NFD4	153 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SGCD	Q92629	289 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	RAB9B	Q9NP90	201 aa		6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	VWF	P04275	2813 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	MYL12B	O14950	172 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CGB3	P0DN86	165 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CGB7	P0DN87	165 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	GTF2F2	P13984	249 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM11	P17152	192 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SSTR5	P35346	364 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CD83	Q01151	205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ST3GAL4	Q11206	333 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	DRAM1	Q8N682	238 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	OR56B4	Q8NH76	319 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	THRSP	Q92748	146 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	GHSR	Q92847	366 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	ARL11	Q969Q4	196 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	VCX	Q9H320	206 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	PSMB11	A5LHX3	300 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	AIP	O00170	330 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	HSD17B6	O14756	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	LALBA	P00709	142 aa		6.96	□□□□□ -1.3
XRCC6-208	ENST00000478914	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3

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