RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 HKR1P10072 659 aa14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.56□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TEX46H3BTG2 121 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 K7EPK0 472 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MLNRO43193 412 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF146Q15072 292 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SHEQ5VZ18 495 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 PCSK4Q6UW60 755 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GAPTQ8N292 157 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZFP57Q9NU63 452 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SH2D1BO14796 132 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TAAR5O14804 337 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FGF2P09038 288 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 KITLGP21583 273 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZP3P21754 424 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SLC35G3Q8N808 338 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FRYQ5TBA9 3013 aa14.55□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 A8MXK9 166 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 K7EM74 188 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 HSD17B6O14756 317 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GCH1P30793 250 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 BVESQ8NE79 360 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 KIRREL1Q96J84 757 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 LUZP4Q9P127 313 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GTF3C1Q12789 2109 aa14.54□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 E5RGE8 158 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FABP6P51161 128 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM56Q96MV1 263 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 HES4Q9HCC6 221 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 FZR1Q9UM11 496 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 NSG2Q9Y328 171 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF695Q8IW36 515 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 SPERTQ8NA61 448 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 C17orf50Q8WW18 174 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 LINC00052Q96N35 136 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.53□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 CRYZL1O95825 349 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 HAND1O96004 215 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 S100GP29377 79 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 TMED6Q8WW62 240 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GLS2Q9UI32 602 aa14.52□□□□□ -0.08
FAAP20-211ENST00000469733 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.52□□□□□ -0.09
FAAP20-211ENST00000469733 A6NLC8 198 aa14.52□□□□□ -0.09
FAAP20-211ENST00000469733 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms