RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q9H521	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CUBN	O60494	3623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SIRPB1	O00241	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PROP1	O75360	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	KDM4B	O94953	1096 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CLIC3	O95833	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALDOB	P05062	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	MELTF	P08582	738 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SELL	P14151	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	BCL3	P20749	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	COX7A1	P24310	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	BDKRB2	P30411	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	TGFBR2	P37173	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEACAM3	P40198	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	KCNJ3	P48549	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	WNT4	P56705	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	TIRAP	P58753	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	RIPK1	Q13546	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF146	Q15072	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q499Y3	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	GHSR	Q92847	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRR25	Q96S07	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A0U1RQK1	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GW55	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PRD5	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PRF3	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PRM7	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550		E9PQ18	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OGG1	O15527	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARG1	P05089	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	GTF2F2	P13984	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEL	P19835	753 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUSP1	P28562	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	BRS3	P32247	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	SAA4	P35542	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	MNDA	P41218	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	PTGFR	P43088	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SH3BGR-208	ENST00000452550	ETV1	P50549	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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