RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 MPV17LQ2QL34 196 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 OR5R1Q8NH85 324 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01006Q8NI28 216 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RFESDQ8TAC1 157 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PHYHIPQ92561 330 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LEAP2Q969E1 77 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 KIRREL1Q96J84 757 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CALYQ9NYX4 217 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087X0M5 115 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GX30 115 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SHISA3A0PJX4 238 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 VGLL3A8MV65 326 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV1-47P01700 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-7P01780 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CRYBA1P05813 215 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 VSIG8P0DPA2 414 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MGMTP16455 207 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CD34P28906 385 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 KCNJ3P48549 501 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 QRFPP83859 136 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 UNC119Q13432 240 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 FAM189A2Q15884 450 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 AANATQ16613 207 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LTC4SQ16873 150 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00596Q86U02 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SPARTQ8N0X7 666 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 UBALD1Q8TB05 177 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC107Q8WV48 283 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 THRSPQ92748 146 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MALSU1Q96EH3 234 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 Q96M66 194 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SLITRK2Q9H156 845 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0A6YYD4 124 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 BTBD17A6NE02 478 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 LY6LH3BQJ8 138 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf65H3BRN8 121 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SLC22A1O15245 554 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MPIG6BO95866 241 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 IL1AP01583 271 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MT-ND4P03905 459 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NFYBP25208 207 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GABARAPL2P60520 117 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GPR176Q14439 515 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RAB12Q6IQ22 244 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM219Q86XT9 240 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 OR4F5Q8NH21 305 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NDNFQ8TB73 568 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 NICN1Q9BSH3 213 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 BEX1Q9HBH7 125 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPE3 182 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 A6NDX4 124 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 POM121CA8CG34 1229 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN9O75954 239 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CD24P25063 80 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 HTR1DP28221 377 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 GABRA5P31644 462 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CLDN12P56749 244 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PROK1P58294 105 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms