RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 PRKACBP22694 351 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MYF6P23409 242 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MTNR1BP49286 362 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ATP1B3P54709 279 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CGB2Q6NT52 195 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 Q8N6K4 173 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR2T29Q8NH02 315 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SLAMF9Q96A28 289 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 EME1Q96AY2 570 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OTULINQ96BN8 352 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 DUX3Q96PT4 197 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CHST6Q9GZX3 395 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 HMG20AQ9NP66 347 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 U3KQV3 271 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 V9GYQ6 96 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 F8VVB4 439 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 F8VWA3 439 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 I3L521 148 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OVOL1O14753 267 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 HSPA12AO43301 675 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 INMTO95050 263 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR2H2O95918 312 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IL1AP01583 271 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IGKV1D-33P01593 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IGKV1-33P01594 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IGLV1-40P01703 118 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CD1BP29016 333 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ADMP35318 185 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CDK5Q00535 292 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 APOFQ13790 326 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 GALEQ14376 348 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 DEFB136Q30KP8 78 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 UTS2BQ765I0 119 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 HDXQ7Z353 690 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CPOQ8IVL8 374 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 LINC00311Q8N616 119 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 Q8N9W7 124 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 NEK6Q9HC98 313 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 HSD17B6O14756 317 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SYT7O43581 403 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 KDM4BO94953 1096 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MOSP00540 346 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MT-ND2P03891 347 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OSMP13725 252 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 PRKACAP17612 351 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 IL3RAP26951 378 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SOX6P35712 828 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 POU3F4P49335 361 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ZP1P60852 638 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 BNIP1Q12981 228 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 GINS1Q14691 196 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 UBE2V2Q15819 145 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM65Q6PI78 240 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 GIPC3Q8TF64 312 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 FEVQ99581 238 aa6.75□□□□□ -1.33
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