RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 FUOMA2VDF0 154 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 F5H5P2 479 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CTDSPLO15194 276 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GRPP07492 148 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 WNT2P09544 360 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 BCL3P20749 454 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GDNFP39905 211 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 BCAP31P51572 246 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GMFBP60983 142 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 BTG1P62324 171 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ASCL4Q6XD76 172 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR8G5Q8NG78 346 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 SEH1LQ96EE3 360 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CST11Q9H112 138 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MMP28Q9H239 520 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GABARAPH6UMI1 98 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CDIPTO14735 213 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 UBBP0CG47 229 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 DUSP1P28562 367 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 PRSS3P35030 304 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MNDAP41218 407 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 DEFA1P59665 94 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 DEFA3P59666 94 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MAB21L1Q13394 359 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ASAH1Q13510 395 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GPR176Q14439 515 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR8G1Q15617 311 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZTK2 550 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 UPRTQ96BW1 309 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 TECTBQ96PL2 329 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR51I2Q9H344 312 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GHRLQ9UBU3 117 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM178BH3BS89 294 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 LYRM1O43325 122 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MT-ND4P03905 459 aa9.25□□□□□ -0.93
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RABGGTA-204ENST00000558376 CAPZA1P52907 286 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP10-3P60369 221 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GNG3P63215 75 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 RELBQ01201 579 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ESCO2Q56NI9 601 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 AQP3Q92482 292 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 RAB3CQ96E17 227 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF205O95201 554 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 KNG1P01042 644 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 MPPED2Q15777 294 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OSR2Q8N2R0 312 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 PXT1Q8NFP0 134 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 Q96M66 194 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 CITED1Q99966 193 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTA-204ENST00000558376 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.24□□□□□ -0.93
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