RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 AHSA2Q719I0 299 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SETD9Q8NE22 299 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PXT1Q8NFP0 134 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 UBALD1Q8TB05 177 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CORO2AQ92828 525 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SMIM19Q96E16 107 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.53□□□□□ -1.04
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NELFE-213ENST00000494956 KIF25Q9UIL4 384 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.53□□□□□ -1.04
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NELFE-213ENST00000494956 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 MAGEB3O15480 346 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CSN2P05814 226 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CD2P06729 351 aa8.52□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 SERPINA2P20848 420 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 HTR1DP28221 377 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 PTGFRP43088 359 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 INSL4Q14641 139 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 HERPUD1Q15011 391 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CHST4Q8NCG5 386 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR52N1Q8NH53 320 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RFESDQ8TAC1 157 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 SGCDQ92629 289 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR14A2Q96R54 314 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 MMP27Q9H306 513 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPE3 182 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 FUOMA2VDF0 154 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 F2RL2O00254 374 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 PIN1P1O15428 100 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 IGLV1-47P01700 117 aa8.51□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 ALDOBP05062 364 aa8.51□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 SSTR5P35346 364 aa8.51□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 PPP3R1P63098 170 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RIPK1Q13546 671 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 IL13RA2Q14627 380 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 NRG4Q8WWG1 115 aa8.51□□□□□ -1.05
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NELFE-213ENST00000494956 METTL9Q9H1A3 318 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RHOFQ9HBH0 211 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RAB18Q9NP72 206 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CALYQ9NYX4 217 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 DPM3Q9P2X0 92 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 IRGMA1A4Y4 181 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CSF1P09603 554 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CELP19835 753 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 CD34P28906 385 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 VHLP40337 213 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 DYNLT3P51808 116 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 BDH1Q02338 343 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-213ENST00000494956 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.5□□□□□ -1.05
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