RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1B0GUS0	222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CHST1	O43916	411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GPX5	O75715	221 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MAS1	P04201	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TGFBR2	P37173	567 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35A2	P78381	396 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SSX2	Q16385	188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CORO2A	Q92828	525 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MUL1	Q969V5	352 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MND1	Q9BWT6	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CD1A	P06126	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GLP1R	P43220	463 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	PROK1	P58294	105 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	BDH1	Q02338	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	IRF3	Q14653	427 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	AANAT	Q16613	207 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TMED9	Q9BVK6	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SPHAR	Q15513	63 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MED22	Q15528	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	NDNF	Q8TB73	568 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	S100A13	Q99584	98 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	C16orf95	Q9H693	158 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876		H0YHG0	523 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	TSPAN9	O75954	239 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CGB3	P0DN86	165 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CGB7	P0DN87	165 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CITED1	Q99966	193 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPSA-208	ENST00000487876	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.4	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.7 ms