RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP23AO75900 390 aa17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP4-204ENST00000416021 SRMP19623 302 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM11P57052 281 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP4-204ENST00000416021 TAF9Q16594 264 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 NKAIN3Q8N8D7 197 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 SUMF2Q8NBJ7 301 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4D6Q8NGJ1 314 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MGLLQ99685 303 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 Q9H521 79 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT22Q9H7X7 185 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF581Q9P0T4 197 aa17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP4-204ENST00000416021 SC5DO75845 299 aa17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP4-204ENST00000416021 OMGP23515 440 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CFPP27918 469 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 AWAT2Q6E213 333 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRTM1Q86UE6 522 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF565Q8N9K5 539 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX3Q99909 188 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 UQCC2Q9BRT2 126 aa17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM133Q9H2Q1 129 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6C3Q9NZP0 311 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR137BO60478 399 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4-204ENST00000416021 CDK2P24941 298 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PAX6P26367 422 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ3P48549 501 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS25P62851 125 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF626Q68DY1 528 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM91Q6ZNR0 172 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00596Q86U02 117 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5R1Q8NH85 324 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PHYHIPQ92561 330 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C1RLQ9NZP8 487 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF25Q9UIL4 384 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIKINA0A087WXM9 373 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ODF3BA8MYP8 253 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 UCHL1P09936 223 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAM1Q15629 374 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MPV17LQ2QL34 196 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAD3CQ5T2N8 411 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP4-204ENST00000416021 GLT8D1Q68CQ7 371 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52W1Q6IF63 320 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 BRICD5Q6PL45 260 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MALSU1Q96EH3 234 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 BANF2Q9H503 90 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HAX1O00165 279 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CGB3P0DN86 165 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CGB7P0DN87 165 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL15P61313 204 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RELBQ01201 579 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf58Q2M2W7 97 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD12Q8N2K0 398 aa17.11■□□□□ 0.33
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SH3BP4-204ENST00000416021 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GHRLQ9UBU3 117 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 VPREB3Q9UKI3 123 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BUX3 64 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MDKP21741 143 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GDNFP39905 211 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GABARAPL2P60520 117 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PAX5Q02548 391 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX2Q16385 188 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 AANATQ16613 207 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35E4Q6ICL7 350 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF367Q7RTV3 350 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNAPQ8N1N2 210 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM104Q8NE00 496 aa17.1■□□□□ 0.33
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