RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 OR4C13Q8NGP0 309 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 YIPF6Q96EC8 236 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 MMP27Q9H306 513 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TCF7L1Q9HCS4 588 aa16.45■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ALDOBP05062 364 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CD36P16671 472 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 DUSP1P28562 367 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP10-3P60369 221 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZNF485Q8NCK3 441 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CHST6Q9GZX3 395 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TMEM133Q9H2Q1 129 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.44■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 A0A0G2JK05 382 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TMEM225BP0DP42 221 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CPEP16870 476 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 PAX5Q02548 391 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CDK5R1Q15078 307 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 UFD1Q92890 307 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 RFT1Q96AA3 541 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SPACA5Q96QH8 159 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CLEC7AQ9BXN2 247 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.43■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 OGG1O15527 345 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZNF44P15621 663 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 EFNB2P52799 333 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 GPR50Q13585 617 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TPBGQ13641 420 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 Q6P435 159 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ASCL4Q6XD76 172 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 OR5D18Q8NGL1 313 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ISOC1Q96CN7 298 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TCF19Q9Y242 345 aa16.42■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SIRPB1O00241 398 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 DEGS1O15121 323 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 KCNJ3P48549 501 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 IL13RA2Q14627 380 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SSX2Q16385 188 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 LY6EQ16553 131 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TPRX1Q8N7U7 411 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZNF596Q8TC21 504 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TMEM106AQ96A25 262 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SMIM19Q96E16 107 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.41■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 CD34P28906 385 aa16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 Q8N2B8 174 aa16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.4■□□□□ 0.22
PITX3-201ENST00000370002 A0A087X0M5 115 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 A0A1B0GX30 115 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ODAMA1E959 279 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GPX5O75715 221 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GABARAPO95166 117 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CALCBP10092 127 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 HTR1DP28221 377 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 AESQ08117 197 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 HERPUD1Q15011 391 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 FAM189A2Q15884 450 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZTK2 550 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 RNF144BQ7Z419 303 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ABHD12Q8N2K0 398 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GPER1Q99527 375 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 IL36GQ9NZH8 169 aa16.39■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 A6NDX4 124 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 AIREO43918 545 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms