RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	BIN1	O00499	593 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLCN6	P51797	869 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GSDMD	P57764	484 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FOXP2	O15409	715 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CASP7	P55210	303 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADAL	Q6DHV7	355 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TJP1	Q07157	1748 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GLI3	P10071	1580 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1W2PQ27	194 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1W2PQ64	194 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1W2PQD8	194 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF28P	B7ZC32	967 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLIM4	O00461	696 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMC2	O95347	1197 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	DPF2	Q92785	391 aa		10.22	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77	3e-7	■□□□□ 8.7
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAST3	O60307	1309 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLIT3	O75094	1523 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.21	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119		M0R2C6	588 aa		10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF790	Q6PG37	636 aa		10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	KCNJ6	P48051	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.2	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	EVC	P57679	992 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	NLRP12	P59046	1061 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	TIMM10	P62072	90 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF202	O95125	648 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	GC	P02774	474 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	PFKFB1	P16118	471 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	FOXO4	P98177	505 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	FANCC	Q00597	558 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPTLC2	O15270	562 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBE2V1-223	ENST00000617119	STK38	Q15208	465 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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