RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC1Q9NV70 894 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 RMND1Q9NWS8 449 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 RTL1A6NKG5 1358 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 GPAA1O43292 621 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 SSH3Q8TE77 659 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM5CP41229 1560 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF5LO75529 589 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX58Q96C10 678 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 SCLT1Q96NL6 688 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 MYOM2P54296 1465 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEJP0CG39 1038 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 BRAPQ7Z569 592 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 NEFHP12036 1026 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC66A2RUB6 948 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 ARMT1Q9H993 441 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO3Q9UK99 471 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 LIG1P18858 919 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf50Q9HD87 102 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CETN1Q12798 172 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 GBP3Q9H0R5 595 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TCIRG1Q13488 830 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ERMNQ8TAM6 284 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 LPIN2Q92539 896 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PLA2R1Q13018 1463 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT2P35908 639 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAF1Q13077 416 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PAFAH1B1P43034 410 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 DTNBO60941 627 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 SKILP12757 684 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 BEND3Q5T5X7 828 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ZAP70P43403 619 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ASIC1P78348 528 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM87BQ96K49 555 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 UFL1O94874 794 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG1Q07617 926 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 VEZTQ9HBM0 779 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PREX2Q70Z35 1606 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF521Q96K83 1311 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMA7O14818 248 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM1O75626 825 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CETN2P41208 172 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TNNI2P48788 182 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 GNG11P61952 73 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 EYA3Q99504 573 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP5JP18859 108 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA4P34932 840 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 USP8P40818 1118 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX11Q8IYF3 940 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF3Q5VWG9 929 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM94Q12767 1356 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 DESP17661 470 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM7P33993 719 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GVL5 298 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC6Q86TZ1 520 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms