RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE6AP16499 860 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2B4P23634 1241 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K12Q12852 859 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 WASHC4Q2M389 1173 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 MSL1Q68DK7 614 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 SP8Q8IXZ3 490 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRK1P26718 216 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 GPSM2P81274 684 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS37DQ86XT2 251 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF3O75054 1194 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH1B1P30837 517 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 MASTLQ96GX5 879 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 LTBP1Q14766 1721 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC14Q96N46 770 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMA5P28066 241 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT32Q14532 448 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS53Q5VIR6 699 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 GPAA1O43292 621 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 GGA1Q9UJY5 639 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXP2O15409 715 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 DDIT3P35638 169 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 STYK1Q6J9G0 422 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC51AQ86UW1 340 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-207ENST00000589146 RUFY3Q7L099 469 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP21A2P08686 494 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 UFL1O94874 794 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNA1SQ13698 1873 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 H0YIN7 160 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CUL4AQ13619 759 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ALX1Q15699 326 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 POLLQ9UGP5 575 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYM6O95789 1325 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 IL1R1P14778 569 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 TMX3Q96JJ7 454 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 AIDAQ96BJ3 306 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 FGAP02671 866 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAT2P19087 354 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP7A1P22680 504 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6KB1P23443 525 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 AK2P54819 239 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 NEK1Q96PY6 1258 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CD209Q9NNX6 404 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 RAI14Q9P0K7 980 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCF2Q9UG63 623 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-207ENST00000589146 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD4O95243 580 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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