RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 IL1R1P14778 569 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 C8orf34Q49A92 452 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 SOGA3Q5TF21 947 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 VPS37DQ86XT2 251 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 SPATA5Q8NB90 893 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 RILPL2Q969X0 211 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 YDJCA8MPS7 323 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 PPIP5K2O43314 1243 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 GRIK5Q16478 980 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 EYA3Q99504 573 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 COA1Q9GZY4 146 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 IL25Q9H293 177 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 SEMA3EO15041 775 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 ZBTB22O15209 634 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 ECE2O60344 883 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 CNTROBQ8N137 903 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 EVI5LQ96CN4 794 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 MXD3Q9BW11 206 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 DOCK2Q92608 1830 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-216ENST00000549221 AK9Q5TCS8 1911 aa9.9□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 CHMLP26374 656 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PRDX5P30044 214 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 GTF2IP78347 998 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 CERS5Q8N5B7 392 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ZNF384Q8TF68 577 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 FSD1Q9BTV5 496 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 A0A0D9SFI3 127 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 CDC45O75419 566 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 SEC24BO95487 1268 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 FAM227BQ96M60 508 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 WDR90Q96KV7 1748 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 HSPA6P17066 643 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 DACT2Q5SW24 774 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PODNQ7Z5L7 613 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 FBXW7Q969H0 707 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ABCF2Q9UG63 623 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 SBF1O95248 1867 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PSME4Q14997 1843 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 MYH7P12883 1935 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 G3V3G9 751 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 RAD17O75943 681 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PDE6AP16499 860 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ADD2P35612 726 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 NIM1KQ8IY84 436 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 OSBP2Q969R2 916 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 BACH2Q9BYV9 841 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 VPS33BQ9H267 617 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 MAST3O60307 1309 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 USP17L3A6NCW0 530 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 USP17L4A6NCW7 530 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 M0R2C6 588 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-216ENST00000549221 PSMD14O00487 310 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms