RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 VPS33BQ9H267 617 aa26.73■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 CD209Q9NNX6 404 aa26.73■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 SNED1Q8TER0 1413 aa26.73■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 IGSF3O75054 1194 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 IL1R1P14778 569 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 PI16Q6UXB8 463 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 RIMBP2O15034 1052 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ACER3-202ENST00000525194 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 BCS1LQ9Y276 419 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K12Q12852 859 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 REC8O95072 547 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 RAD50Q92878 1312 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 PODNQ7Z5L7 613 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 ABCF2Q9UG63 623 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 SGSM2O43147 1006 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 PPIP5K2O43314 1243 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 SYT17Q9BSW7 474 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-202ENST00000525194 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.64■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 DOCK2Q92608 1830 aa26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 UBE3CQ15386 1083 aa26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 DOK7Q18PE1 504 aa26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.63■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 SEC24BO95487 1268 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ADD2P35612 726 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 AOC3Q16853 763 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 RAI14Q9P0K7 980 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.62■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 MYH7P12883 1935 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 APPBP2Q92624 585 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 FAM227BQ96M60 508 aa26.61■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ECE2O60344 883 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 PDE6AP16499 860 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.6■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 A0A0D9SFI3 127 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 GTF2IP78347 998 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.59■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.58■■□□□ 1.85
ACER3-202ENST00000525194 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 GSTO1P78417 241 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.57■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 NIM1KQ8IY84 436 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 FBXW7Q969H0 707 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 JAG2Q9Y219 1238 aa26.56■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 USP17L3A6NCW0 530 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 USP17L4A6NCW7 530 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 NFKBIEO00221 500 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 SLF2Q8IX21 1173 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 JDP2Q8WYK2 163 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 LDHCP07864 332 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 CYP7A1P22680 504 aa26.54■■□□□ 1.84
ACER3-202ENST00000525194 MECOMQ03112 1051 aa26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms