RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 DACH1Q9UI36 760 aa8.68□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.68□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.68□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SPTLC2O15270 562 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 CMA1P23946 247 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 MCM3P25205 808 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 USP5P45974 858 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 GNG11P61952 73 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 ST5P78524 1137 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 NCAPHQ15003 741 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 LINS1Q8NG48 757 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.67□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SASH3O75995 380 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF202O95125 648 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM71BQ8TC56 605 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 DEF6Q9H4E7 631 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 MED4Q9NPJ6 270 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GVL5 298 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 GRM8O00222 908 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 SASH1O94885 1247 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFA8P51970 172 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 APOBRQ0VD83 1088 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB21Q9UL25 225 aa8.66□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.65□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 LAMA4Q16363 1823 aa8.65□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.65□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.65□□□□□ -1.02
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP6R2O75170 966 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CYP21A2P08686 494 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC175P0C221 793 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 USP8P40818 1118 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CHMP4BP1P59074 171 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 PIP4K2BP78356 416 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 TEFQ10587 303 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 C8orf76Q96K31 380 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 ATG3Q9NT62 314 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.65□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF5CO60282 957 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 GUCY2CP25092 1073 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 SYKP43405 635 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 NWD1Q149M9 1564 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 PALLDQ8WX93 1383 aa8.64□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CUTAO60888 179 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 DTNBO60941 627 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CTDNEP1O95476 244 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 CPP00450 1065 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 HOXC9P31274 260 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 MAP9Q49MG5 647 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 ANO1Q5XXA6 986 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.63□□□□□ -1.03
HMBOX1-211ENST00000524238 KIFC2Q96AC6 838 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms