RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
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TSNARE1-205ENST00000520166 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.63■□□□□ 0.89
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TSNARE1-205ENST00000520166 M0R2C6 588 aa20.56■□□□□ 0.88
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TSNARE1-205ENST00000520166 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.53■□□□□ 0.88
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TSNARE1-205ENST00000520166 DOCK2Q92608 1830 aa20.52■□□□□ 0.88
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TSNARE1-205ENST00000520166 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 CYP7A1P22680 504 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 MYH7P12883 1935 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-205ENST00000520166 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.49■□□□□ 0.87
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