RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDPK1O15530 556 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSAPP07602 524 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HYAL2Q12891 473 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEPT6Q14141 434 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLD4Q96BZ4 506 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNMA5Q96PV4 448 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GDF9O60383 454 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF4AO95239 1232 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 GIPRP48546 466 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GYS2P54840 703 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNQ4P56696 695 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HHIPQ96QV1 700 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A096LPE4 126 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PPZ6 126 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL8A6PVC2 850 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F11P03951 625 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITPKAP23677 461 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMPD3Q01432 767 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAAP100Q0VG06 881 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFHC2Q5JST6 749 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GK5Q6ZS86 529 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPME1Q9Y570 386 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF165P49910 485 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLAURQ03405 335 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SQSTM1Q13501 440 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASGRF1Q13972 1273 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPP2Q14168 576 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARSHQ5FYA8 562 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KANK3Q6NY19 840 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP120Q8N960 986 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC3Q9BY71 257 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF576Q9H609 170 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX18P35713 384 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLCQ05315 142 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R5EQ16537 467 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FXNQ16595 210 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTERF2Q49AM1 385 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXPE3Q969Y0 559 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM260Q9NX78 707 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM221AA4D161 298 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFSO43281 561 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM157BP0CG42 384 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TKFCQ3LXA3 575 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASIP1Q5U651 963 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BHMTQ93088 406 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRN4Q9NRL3 753 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFKBIEO00221 500 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDAH1O94760 285 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJB6O95452 261 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BPNT1O95861 308 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MASP1P48740 699 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf27AQ580R0 203 aa6.83□□□□□ -1.32
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