RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MDFI	Q99750	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ENC1	O14682	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RLBP1	P12271	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDC27	P30260	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDC25B	P30305	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRT76	Q01546	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PWP1	Q13610	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IRF7	Q92985	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACD	Q96AP0	544 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PAGE1	O75459	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPX	P11678	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPHA1	P21709	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LIG3	P49916	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALB	P02768	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PF4	P02776	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CABP4	P57796	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PAK2	Q13177	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IKBKE	Q14164	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC9	Q92623	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784		M0R082	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LILRB5	O75023	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	B3GALT4	O96024	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LMNB1	P20700	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AMPD1	P23109	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIK5	Q16478	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784		H3BRJ5	948 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BCR	P11274	1271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NME2	P22392	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BAG6	P46379	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GSTM4	Q03013	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARID5A	Q03989	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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