RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	FGFR2	P21802	821 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SEMA3E	O15041	775 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	HSPA6	P17066	643 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	APLP1	P51693	650 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SCARF1	Q14162	830 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	AAMP	Q13685	434 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	AACS	Q86V21	672 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	MAST3	O60307	1309 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ADORA1	P30542	326 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	PHKA1	P46020	1223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	NF2	P35240	595 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	GML	Q99445	158 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKP4-208	ENST00000462335		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TNNI2	P48788	182 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	GSTO1	P78417	241 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	WNT10B	O00744	389 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	NEFL	P07196	543 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	LDHC	P07864	332 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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