RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 CD209Q9NNX6 404 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 SGSM2O43147 1006 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K12Q12852 859 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 COA1Q9GZY4 146 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 RAD50Q92878 1312 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 G3V3G9 751 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 RIMBP2O15034 1052 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 IL1R1P14778 569 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 SLX4Q8IY92 1834 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM227BQ96M60 508 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 IGSF3O75054 1194 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCF2Q9UG63 623 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 UBE3CQ15386 1083 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 PSMD1Q99460 953 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 UTRNP46939 3433 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A0D9SFI3 127 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 USP26Q9BXU7 913 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 AK9Q5TCS8 1911 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ADD2P35612 726 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 APPBP2Q92624 585 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 VPS33BQ9H267 617 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 RAI14Q9P0K7 980 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE6AP16499 860 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 LTBP1Q14766 1721 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 PODNQ7Z5L7 613 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 BCS1LQ9Y276 419 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 DOK7Q18PE1 504 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 IL25Q9H293 177 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 SNED1Q8TER0 1413 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 MCCP23508 829 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 PPIP5K2O43314 1243 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 CHGBP05060 677 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 OSBP2Q969R2 916 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIN3BO60391 1043 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 JAG2Q9Y219 1238 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 CACNA1SQ13698 1873 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 GTF2IP78347 998 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR162Q16538 588 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 AOC3Q16853 763 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP7A1P22680 504 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 MAST3O60307 1309 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ECE2O60344 883 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 GSTO1P78417 241 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 M0R2C6 588 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms