RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Shisa4Q8CA71 197 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MthfsQ9D110 203 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aox1O54754 1333 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stat1P42225 749 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnat2P50149 354 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FanccP50652 591 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pald1P70261 859 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt40Q6IFX3 439 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CpzQ8R4V4 654 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Jdp2P97875 163 aa23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BrapQ99MP8 591 aa23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myh13B1AR69 1938 aa23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bend4P86174 541 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psd3Q2PFD7 1037 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1810065E05RikQ5NC41 235 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc14a2Q8R4T9 930 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 IcoslgQ9JHJ8 322 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stx6Q9JKK1 255 aa23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf326O88291 580 aa23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp6v0a2P15920 856 aa23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5592Q3V0A6 857 aa23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cxcl11Q9JHH5 100 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm29094F6Q785 221 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcm4P49717 862 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wdhd1P59328 1117 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hand2Q61039 217 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lmod1Q8BVA4 595 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nup188Q6ZQH8 1759 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2d34L7N463 504 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Casp12O08736 419 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slurp2P0DP59 97 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PogkQ80TC5 607 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sned1Q70E20 1403 aa23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CrcpO35427 148 aa23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep57l1Q8VDS7 400 aa23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cnot6lQ8VEG6 555 aa23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Siah1aP61092 282 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ctdnep1Q3TP92 244 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp24a1Q64441 514 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pms1Q8K119 917 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt24A1L317 512 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spg7Q3ULF4 781 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm43Q99J64 343 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NapbP28663 298 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbln2P37889 1221 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NfixP70257 488 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Odf2lQ9D478 642 aa23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cpa2Q504N0 417 aa23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ces1dQ8VCT4 565 aa23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt84Q99M73 603 aa23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 StrcQ8VIM6 1809 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc4a4O88343 1079 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep55Q8BT07 462 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr108Q91WD0 569 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pla2g12bQ99P27 195 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Letm1Q9Z2I0 738 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myh2G3UW82 1942 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Med23Q80YQ2 1367 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mapkapk5O54992 473 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apba2P98084 750 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmed8Q3UHI4 326 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tsr2Q8C8T8 191 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kcnq3Q8K3F6 873 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb43Q9DAI4 467 aa23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wdr19Q3UGF1 1341 aa23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ercc3P49135 783 aa23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif22Q3V300 660 aa23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Iffo2Q8R2V2 512 aa23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CpdO89001 1377 aa23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aox3G3X982 1335 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ImpactO55091 318 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Best3Q6H1V1 669 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cfap69Q8BH53 942 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 WdpcpQ8C456 722 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp113Q8C689 439 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rufy2Q8R4C2 606 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Limch1Q3UH68 1057 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Agtpbp1Q641K1 1218 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eaf2Q91ZD6 262 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pold4Q9CWP8 107 aa23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cnnm2Q3TWN3 875 aa23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep63Q3UPP8 700 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 119.4 ms