RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	NAA60	Q9H7X0	242 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DECR2	Q9NUI1	292 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152		F8W036	122 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DEDD	O75618	318 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NGF	P01138	241 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	BCL3	P20749	454 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ID4	P47928	161 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PRRX2	Q99811	253 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MED6	O75586	246 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FUT3	P21217	361 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM187	Q14656	261 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	VASH2	Q86V25	355 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SYNGR4	O95473	234 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	AADAC	P22760	399 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PRDX4	Q13162	271 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MST1L	Q2TV78	715 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152		R4GN57	208 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GLP1R	P43220	463 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LPAR6	P43657	344 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HERV-K104	P61576	105 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM45B	Q96B21	275 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.27	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RAB1A	P62820	205 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	EXTL1	Q92935	676 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	STARD10	Q9Y365	291 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1D1	P51857	326 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	MMP26	Q9NRE1	261 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TP53RK	Q96S44	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TAAR5	O14804	337 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PPY	P01298	95 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SVBP	Q8N300	66 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	CST4	P01036	141 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ASCL1	P50553	236 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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