RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC22A25Q6T423 547 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.21□□□□□ -0.13
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL18BPO95998 194 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLP1RP43220 463 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPM6AP51674 278 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 S100A10P60903 97 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARG2P78540 354 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPV17LQ2QL34 196 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLRX5Q86SX6 157 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MKXQ8IYA7 352 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.17□□□□□ -0.14
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.17□□□□□ -0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIGMQ9H3S5 423 aa14.17□□□□□ -0.14
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