RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PQ09 198 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 H0YJX3 145 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM77I1YAP6 450 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 M0R1W7 72 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 SLC1A7O00341 560 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 HAND1O96004 215 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 HCKP08631 526 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 PRKACAP17612 351 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 PRTN3P24158 256 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 DLX6P56179 175 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF146Q15072 292 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 KISS1Q15726 138 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 Q6YL49 198 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 MKXQ8IYA7 352 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 STX19Q8N4C7 294 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 GPR148Q8TDV2 347 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 C17orf50Q8WW18 174 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM106AQ96A25 262 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 JMJD8Q96S16 334 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 CHST6Q9GZX3 395 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 HMG20AQ9NP66 347 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPK0 400 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM89A2RUT3 159 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 PTGES3LE9PB15 166 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 GABRPO00591 440 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 PIN1P1O15428 100 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 CDK1P06493 297 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 CHRM2P08172 466 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 MELTFP08582 738 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OCM2P0CE71 109 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 RAB3AP20336 220 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 MYF6P23409 242 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OR3A1P47881 315 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 BPIFB3P59826 476 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 Q6P435 159 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 AJUBAQ96IF1 538 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 OR5M11Q96RB7 305 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CLDN34H7C241 214 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SIRPB1O00241 398 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V1G2O95670 118 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR2H2O95918 312 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM225BP0DP42 221 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PAX6P26367 422 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR3A4PP47883 348 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 WNT4P56705 351 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ACTG1P63261 375 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35A2P78381 396 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 EDDM3AQ14507 147 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 INSL4Q14641 139 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IRF3Q14653 427 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RNLSQ5VYX0 342 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SATL1Q86VE3 508 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 Q8IYB0 196 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR8H2Q8N162 312 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SNX22Q96L94 193 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR14A2Q96R54 314 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 NEK6Q9HC98 313 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0G2JK05 382 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 C17orf98A8MV24 154 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MYL12BO14950 172 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 NPFFO15130 113 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms