RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631057.2

GPC3-204, Transcript of glypican 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC3, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3-204ENST00000631057 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FAM122CQ6P4D5 195 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 VHLLQ6RSH7 139 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ATRAIDQ6UW56 229 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 DHRS11Q6UWP2 260 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TMEM200AQ86VY9 491 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 C1orf210Q8IVY1 113 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OSR2Q8N2R0 312 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SVBPQ8N300 66 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OR5T2Q8NGG2 359 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OR51F2Q8NH61 342 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CT55Q8WUE5 264 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TMEM45BQ96B21 275 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZPBPQ9BS86 351 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FAAP24Q9BTP7 215 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 WNT5BQ9H1J7 359 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ACKR4Q9NPB9 350 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZFP57Q9NU63 452 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ATPIF1Q9UII2 106 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TUBD1Q9UJT1 453 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 K7EPK0 472 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 M0R296 226 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TOR1AO14656 332 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PDCD6O75340 191 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PLATP00750 562 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FAM157CP0CG43 387 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 HKR1P10072 659 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CTRB1P17538 263 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TCN2P20062 427 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ACP1P24666 158 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 NTF4P34130 210 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OPRM1P35372 400 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PMELP40967 661 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 GLP1RP43220 463 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PIGPP57054 158 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FAM3AP98173 230 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 Q0VFX4 171 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 MALLQ13021 153 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 NRN1LQ496H8 165 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 GALNT14Q96FL9 552 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 STRADBQ9C0K7 418 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 NAA60Q9H7X0 242 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 VCANP13611 3396 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SPEGQ15772 3267 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 DEDDO75618 318 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CST4P01036 141 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PATE4P0C8F1 98 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 UCP3P55916 312 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 BLOC1S1P78537 153 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF92Q03936 586 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 TMEM187Q14656 261 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SLC22A25Q6T423 547 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SKA3Q8IX90 412 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SPSB4Q96A44 273 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC3-204ENST00000631057 SMIM8Q96KF7 97 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms