RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CAV2P51636 162 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 AKR1D1P51857 326 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CCL23P55773 120 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R19P59542 299 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ACTBP60709 375 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ACTG1P63261 375 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CSNK1G2P78368 415 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 BEX3Q00994 111 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 IL15RAQ13261 267 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 Q499Y3 187 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 C17orf64Q86WR6 236 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 VRK2Q86Y07 508 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 COMMD1Q8N668 190 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR52B4Q8NGK2 314 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR2L2Q8NH16 312 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.16□□□□□ -1.74
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TRDN-204ENST00000542443 CDS1Q92903 461 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 DTD2Q96FN9 168 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 COX14Q96I36 57 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CASD1Q96PB1 797 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 AQP10Q96PS8 301 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 STACQ99469 402 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 GINS4Q9BRT9 223 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NMES1Q9C002 83 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MED20Q9H944 212 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 BEX1Q9HBH7 125 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.15□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.15□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.15□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC17A2O00624 439 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GOSR2O14653 212 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SGCEO43556 437 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 VEGFDO43915 354 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SSX5O60225 188 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 AKR7A3O95154 331 aa4.15□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 IFNA10P01566 189 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RPN2P04844 631 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CRHP06850 196 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR8U8P0C7N1 319 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TBPP20226 339 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 EDNRAP25101 427 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CD70P32970 193 aa4.15□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 CX3CR1P49238 355 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC11A1P49279 550 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FKBP1BP68106 108 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 DHRS2Q13268 280 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PEA15Q15121 130 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR1Q1Q15612 314 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 Q3ZCU0 254 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FHL5Q5TD97 284 aa4.15□□□□□ -1.75
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