RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		H3BNX3	289 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		J3QRE1	110 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	APOL3	O95236	402 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PPE2	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PR64	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PRV1	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		A6NIN4	97 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		H0YAE9	185 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	EI24	O14681	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ENTPD6	O75354	484 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TK1	P04183	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ISG15	P05161	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	SAA4	P35542	130 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CAPZA1	P52907	286 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		K7N7A8	449 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	PAH	P00439	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TGFBR2	P37173	567 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CCR9	P51686	369 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	KLRD1	Q13241	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TAF9	Q16594	264 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	AANAT	Q16613	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524		Q8IYB0	196 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CITED1	Q99966	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC16A6	O15403	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	MPZL2	O60487	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CLPX	O76031	633 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CHRM2	P08172	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RBP2	P50120	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	DLX1	P56177	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIFC3-208	ENST00000561524	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF737	O75373	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	TSPAN9	O75954	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RBP4	P02753	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	GABRB1	P18505	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ATP1B3	P54709	279 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ACTA2	P62736	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ACTG2	P63267	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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