RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 HES4Q9HCC6 221 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 S100A14Q9HCY8 104 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 MEIOCA2RUB1 952 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 H0YAE9 185 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 J3QLW9 94 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 GPR137BO60478 399 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 CRYBA1P05813 215 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZNF19P17023 458 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 MPZP25189 248 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SAA4P35542 130 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 RAG2P55895 527 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 COL10A1Q03692 680 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZNF91Q05481 1191 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TMED1Q13445 227 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 OCLNQ16625 522 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 AJUBAQ96IF1 538 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 C4orf36Q96KX1 117 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SPACA5Q96QH8 159 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ADI1Q9BV57 179 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 CHST5Q9GZS9 411 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 RASL12Q9NYN1 266 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 M0R1W7 72 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SLC1A7O00341 560 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ANGPTL7O43827 346 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TK1P04183 234 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 HTR1AP08908 422 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 COX7A1P24310 79 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 DUSP1P28562 367 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 NPBWR2P48146 333 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 POU3F4P49335 361 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 BMXP51813 675 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 IL24Q13007 206 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ZNF561Q8N587 486 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 APH1BQ8WW43 257 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 ITFG2Q969R8 447 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FGGYQ96C11 551 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 PELI1Q96FA3 418 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 BORCS8Q96FH0 119 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 CEP19Q96LK0 163 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 PKIBQ9C010 78 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 E9PI62 339 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 EBAG9O00559 213 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SLC16A6O15403 523 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 BAG2O95816 211 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 CLIC3O95833 236 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 KNG1P01042 644 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 IGHA1P01876 353 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FBP1P09467 338 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 BCL3P20749 454 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 UBE2E1P51965 193 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 FUT6P51993 359 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 EDDM3BP56851 147 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZSV7 163 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-213ENST00000494956 TCF23Q7RTU1 214 aa8.65□□□□□ -1.02
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