RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 IL20Q9NYY1 176 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF222Q9UK12 451 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 GASTP01350 101 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PSG2P11465 335 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFB7P17568 137 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FMO3P31513 532 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OPRL1P41146 370 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH3A2P51648 485 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 BMXP51813 675 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A1P53007 311 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 CAV3P56539 151 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM11AP58511 58 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PRDX4Q13162 271 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 TIGD6Q17RP2 521 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 TTC23Q5W5X9 447 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T29Q8NH02 315 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 CYGBQ8WWM9 190 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 TFAP2CQ92754 450 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PHF21AQ96BD5 680 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NRBF2Q96F24 287 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 REEP1Q9H902 201 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 VNN3Q9NY84 501 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQ09 198 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FAM183AA6NL82 134 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR2AT4A6NND4 320 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 H0YAE9 185 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 EI24O14681 340 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ANGPTL7O43827 346 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SOX14O95416 240 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 CAPGP40121 348 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 GABRA2P47869 451 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RAB13P51153 203 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 TIGD4Q8IY51 512 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N2B8 174 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PIGCQ92535 297 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 MED30Q96HR3 178 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RNF170Q96K19 258 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 MICU1Q9BPX6 476 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ADI1Q9BV57 179 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 NLKQ9UBE8 527 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM210A6NLX4 147 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 K7EIL1 84 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DLGAP1O14490 977 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CST4P01036 141 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CCL3L1P16619 93 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 POU1F1P28069 291 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HSD11B1P28845 292 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GNALP38405 381 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IFNGR2P38484 337 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA2P43356 314 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms