RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550047.5

SLC8B1-210, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC8B1, Length 2,493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-210ENST00000550047 PIGPP57054 158 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 RNF4P78317 190 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 MYBPHQ13203 477 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 ARL6IP1Q15041 203 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 XRCC2O43543 280 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 CA11O75493 328 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 DIRAS3O95661 229 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 RAB2AP61019 212 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 PPA1Q15181 289 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 C1orf189Q5VU69 101 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 RTL6Q6ICC9 239 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 S100A13Q99584 98 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 OR2C1O95371 312 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 CLINT1Q14677 625 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 OPN1LWP04000 364 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 OR5H8P0DN80 308 aa14.88□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 ZNF43P17038 809 aa14.88□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 GPR157Q5UAW9 335 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.88□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 TMEM187Q14656 261 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.88□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 TOMM40LQ969M1 308 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 CLEC1BQ9P126 229 aa14.87□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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SLC8B1-210ENST00000550047 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 RARRES2Q99969 163 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 NAA60Q9H7X0 242 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 SPEGQ15772 3267 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 A0A1B0GW64 132 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 A0A1W2PPC4 97 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC8B1-210ENST00000550047 HOXA5P20719 270 aa14.86□□□□□ -0.03
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