RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 FGFRL1Q8N441 504 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 POC1AQ8NBT0 407 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ZNF485Q8NCK3 441 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 RPS4Y2Q8TD47 263 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ZNF488Q96MN9 340 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 TECTBQ96PL2 329 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 FKBP14Q9NWM8 211 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 SLC7A11Q9UPY5 501 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 C22orf46C9J442 243 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 DVL1O14640 695 aa13.05□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 CDK5R1Q15078 307 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 CCDC58Q4VC31 144 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.05□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 OR52N1Q8NH53 320 aa13.05□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.05□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 OGG1O15527 345 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 SELLP14151 372 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ZNF20P17024 532 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ATF1P18846 271 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 IL24Q13007 206 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF788Q6ZQV5 615 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 DNAAF1Q8NEP3 725 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF222Q9UK12 451 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 AUP1Q9Y679 476 aa13.04□□□□□ -0.32
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ACTB-206ENST00000443528 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 OR2AT4A6NND4 320 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 SLC1A7O00341 560 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 RPSAP08865 295 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 PSG2P11465 335 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 MYF6P23409 242 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ERVK11-1P61568 191 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 MED21Q13503 144 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 DOC2BQ14184 412 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 BATF2Q8N1L9 274 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 STX19Q8N4C7 294 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 BORCS8Q96FH0 119 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 MRI1Q9BV20 369 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD60Q9BZ19 345 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 HES4Q9HCC6 221 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-206ENST00000443528 SIGLEC5O15389 551 aa13.02□□□□□ -0.33
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ACTB-206ENST00000443528 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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ACTB-206ENST00000443528 IKZF1Q13422 519 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 CD276Q5ZPR3 534 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 BTN2A1Q7KYR7 527 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 RNF144BQ7Z419 303 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.02□□□□□ -0.33
ACTB-206ENST00000443528 TEX29Q8N6K0 151 aa13.02□□□□□ -0.33
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