RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARPC5	O15511	151 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OGG1	O15527	345 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST8SIA3	O43173	380 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPZL2	O60487	215 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEC14L2	O76054	403 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBL3	O95164	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB36	O95755	333 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAF1	P04049	648 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RLN1	P04808	185 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD79A	P11912	226 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	B4GALT1	P15291	398 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLRA1	P23415	457 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	FMO3	P31513	532 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDA	P32320	146 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GGT2	P36268	569 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR12	P47775	334 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMP15	P51511	669 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A1	P53007	311 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCBD1	P61457	104 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSF2	Q03933	536 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLP2	Q04941	152 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	FMOD	Q06828	376 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RIN1	Q13671	783 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GABRA6	Q16445	453 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSG3	Q16557	428 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST3H3	Q16695	136 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC36A2	Q495M3	483 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	C12orf73	Q69YU5	71 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINGO2	Q7L985	606 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC18	Q8N456	261 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR52N5	Q8NH56	324 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01560	Q8TB33	94 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM163	Q8TC26	289 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPSB1	Q96BD6	273 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MUS81	Q96NY9	551 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLE	Q07864	2286 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PR80	420 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR6C68	A6NDL8	312 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0R1B8	84 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHYH	O14832	338 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTH	P01270	115 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GYPB	P06028	91 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RD3L	P0DJH9	198 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTLA4	P16410	223 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPI1	P17947	270 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAX6	P26367	422 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	PYCR1	P32322	319 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARR3	P36575	388 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	VHL	P40337	213 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADAM8	P78325	824 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL5RA	Q01344	420 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF91	Q05481	1191 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TFF3	Q07654	80 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB32	Q13637	225 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	KEAP1	Q14145	624 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAB1	Q15750	504 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSG1	Q2KHT4	349 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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